RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 MYL12BO14950 172 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RAB43Q86YS6 212 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 POMPQ9Y244 141 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MAGEB2O15479 319 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 BPGMP07738 259 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HMBSP08397 361 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TSPAN19P0C672 248 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CA9Q16790 459 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CDH19Q9H159 772 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ALOX15BO15296 676 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CYP1A2P05177 515 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SERPIND1P05546 499 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 NAMPTP43490 491 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ENTPD1P49961 510 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 STILQ15468 1287 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 XKR5Q6UX68 686 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CISHQ9NSE2 258 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 JCHAINP01591 159 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SOX10P56693 466 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SQLEQ14534 574 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 NXNL1Q96CM4 212 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TNIP3Q96KP6 325 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CST1P01037 141 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HMGCRP04035 888 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CNPY3Q9BT09 278 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PDLIM1O00151 329 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FSCN2O14926 492 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MTSS1O43312 755 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TBX1O43435 398 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CYP2C8P10632 490 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 NCAM1P13591 858 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 GGA3Q9NZ52 723 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ANXA9O76027 345 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ECT2LQ008S8 904 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 DPY30Q9C005 99 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HDAC3O15379 428 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 H6PDO95479 791 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.86□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 BIRC5O15392 142 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 NPTX2P47972 431 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TUBA1BP68363 451 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TUBA1AQ71U36 451 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HPDLQ96IR7 371 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 C3orf18Q9UK00 162 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 INVSQ9Y283 1065 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 GABRB2P47870 512 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 LPGAT1Q92604 370 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 U3KQV3 271 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PIK3C2AO00443 1686 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TAS2R40P59535 323 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MYL6P60660 151 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ADGRE1Q14246 886 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 18.1
PCNX1-202ENST00000439984 CD151P48509 253 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 C5orf22Q49AR2 442 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SFT2D3Q587I9 215 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 H3BN98 237 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ACTR3P61158 418 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 BNC1Q01954 994 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 XKR3Q5GH77 459 aa14.85□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 URGCPQ8TCY9 931 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms