RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 NOX5Q96PH1 765 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 CALN1Q9BXU9 219 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DPH1Q9BZG8 443 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ABCG4Q9H172 646 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DDIT4Q9NX09 232 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS28Q9UK41 221 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 K7ESM1 405 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 KLK10O43240 276 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MED7O43513 233 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 CLDN11O75508 207 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SMC2O95347 1197 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MT-CO1P00395 513 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 GLI1P08151 1106 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SRCP12931 536 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MYF5P13349 255 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 CLDN2P57739 230 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 VAC14Q08AM6 782 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MTA1Q13330 715 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DEFB106AQ8N104 65 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 TTC9Q92623 222 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF34Q969K3 372 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ARRDC3Q96B67 414 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SEMA4CQ9C0C4 833 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 FZD3Q9NPG1 666 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 THSD1Q9NS62 852 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ATMQ13315 3056 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 B8ZZF3 427 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMA7O14818 248 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT5P13647 590 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 C6P13671 934 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 PDCLQ13371 301 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ISXQ2M1V0 245 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 C5orf22Q49AR2 442 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 Q6ZSR6 202 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 C14orf80Q86SX3 495 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 BMFQ96LC9 184 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC114Q96M63 670 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 HDAC8Q9BY41 377 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 GPR27Q9NS67 375 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 COX16Q9P0S2 106 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 HECTD1Q9ULT8 2610 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 K7ERQ8 282 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF103O00237 685 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SNAP91O60641 907 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDH8O95206 1070 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 PRNPP04156 253 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 CDH4P55283 916 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT83P78385 493 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SKOR1P84550 965 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 LY6DQ14210 128 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MAPK15Q8TD08 544 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SMARCE1Q969G3 411 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 PSMB7Q99436 277 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 MUC3BQ9H195 1237 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 ACP6Q9NPH0 428 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DYRK4Q9NR20 520 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
ACTBP11-201ENST00000436287 A6NNZ2 444 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTBP11-201ENST00000436287 THAP12O43422 761 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTBP11-201ENST00000436287 HSF2BPO75031 334 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms