RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF460Q14592 562 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DCAF6Q58WW2 860 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TREML2Q5T2D2 321 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ISL2Q96A47 359 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM210AQ96ND0 272 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OMDQ99983 421 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ACOT8O14734 319 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SBK3P0C264 359 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SETSIPP0DME0 302 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EDNRBP24530 442 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HSPA13P48723 471 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIZQ2M2Z5 673 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNX31Q8N9S9 440 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLUD2P49448 558 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNX16P57768 344 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RALGDSQ12967 914 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRKAA1Q13131 559 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRIM74Q86UV6 250 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRIM73Q86UV7 250 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DLG3Q92796 817 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SGF29Q96ES7 293 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HDCP19113 662 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EMP3P54852 163 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM135Q86UB9 458 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NUP93Q8N1F7 819 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 APBA2Q99767 749 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VPS28Q9UK41 221 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BTBD19C9JJ37 291 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NMBRP28336 390 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DGKDQ16760 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LSMEM2Q8N112 164 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AP4S1Q9Y587 144 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TIMM44O43615 452 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C22orf31O95567 290 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 INSRRP14616 1297 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LMO2P25791 158 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PTPN3P26045 913 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDH15P55291 814 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KRT80Q6KB66 452 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TTC39CQ8N584 583 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CIB1Q99828 191 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 THEGQ9P2T0 379 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GINS2Q9Y248 185 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRIM38O00635 465 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HBP1O60381 514 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AP2A1O95782 977 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PSME3P61289 254 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP41Q3LFD5 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MTX3Q5HYI7 312 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms