RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424751.2

LINC00839-201, long intergenic non-protein coding RNA 839, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00839, Length 2,252 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00839-201ENST00000424751 RFX8Q6ZV50 586 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 NRG4Q8WWG1 115 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 IFT43Q96FT9 208 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PDP2Q9P2J9 529 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 OBSL1O75147 1896 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 WDR91A4D1P6 747 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 H7C4K7 107 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TBX10O75333 385 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ABLIM3O94929 683 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ITGAVP06756 1048 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 CDK16Q00536 496 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 OVGP1Q12889 678 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PLD1Q13393 1074 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 MSS51Q4VC12 460 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ZNF276Q8N554 614 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 SKA1Q96BD8 255 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 SLC22A12Q96S37 553 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 CERS4Q9HA82 394 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 C2orf78A6NCI8 922 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 DCLK1O15075 740 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 LILRB3O75022 631 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TMEM63AO94886 807 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 IRS1P35568 1242 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ARL4CP56559 192 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 BANPQ8N9N5 519 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 GKN1Q9NS71 199 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 YIPF1Q9Y548 306 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 FAM92AA1XBS5 289 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 GJA1P17302 382 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 GPX6P59796 221 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TWF1Q12792 350 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 MON1AQ86VX9 555 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TTC16Q8NEE8 873 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 CPT1BQ92523 772 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 GATA6Q92908 595 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PAFAH2Q99487 392 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 RNF38Q9H0F5 515 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PIDD1Q9HB75 910 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00839-201ENST00000424751 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 MCF2LO15068 1137 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 AVILO75366 819 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 METTL18O95568 372 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 LAG3P18627 525 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 SERPINB3P29508 390 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 RPS6KA3P51812 740 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 ZXDBP98169 803 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 CHSY1Q86X52 802 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 SCML4Q8N228 414 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 FIBCD1Q8N539 461 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 RNF217Q8TC41 542 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 P2RY11Q96G91 374 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00839-201ENST00000424751 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms