RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409766.7

USP39-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP39, Length 2,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-204ENST00000409766 KCNMB4Q86W47 210 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 DCLK2Q8N568 766 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ZNF778Q96MU6 729 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 HOXA2O43364 376 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 RHOQP17081 205 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ADRA1AP35348 466 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PBX3P40426 434 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 NDST2P52849 883 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ARFIP2P53365 341 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SMARCB1Q12824 385 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PSMD5Q16401 504 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PPM1JQ5JR12 505 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 C16orf46Q6P387 395 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SNX15Q9NRS6 342 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PLIN3O60664 434 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PEX11BO96011 259 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 T-ENOLP0DO92 83 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 GEMP55040 296 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MIB1Q86YT6 1006 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 IPMKQ8NFU5 416 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 AZIN2Q96A70 460 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 BPTFQ12830 3046 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 IGLV3-27P01718 113 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PRKCGP05129 697 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 IRX4P78413 519 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ANO4Q32M45 955 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ALFQ53S48 1182 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PCID2Q5JVF3 399 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 COMMD8Q9NX08 183 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 HEY2Q9UBP5 337 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 H7C4K7 107 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CNTN5O94779 1100 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SERPINB8P50452 374 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 DUSP4Q13115 394 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MPP3Q13368 585 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FATE1Q969F0 183 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 TTPALQ9BTX7 342 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 FICDQ9BVA6 458 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 MYLKQ15746 1914 aa20.46■□□□□ 0.87
USP39-204ENST00000409766 PROCP04070 461 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 KRT16P08779 473 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 MBLAC2Q68D91 279 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 FBXL22Q6P050 247 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 SKA1Q96BD8 255 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 HMCESQ96FZ2 354 aa20.45■□□□□ 0.86
USP39-204ENST00000409766 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms