RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADAM2Q99965 735 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MSH3P20585 1137 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 S100A3P33764 101 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 C21orf59P57076 290 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP4Q13107 963 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZACNQ401N2 412 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 BBS12Q6ZW61 710 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CEP44Q9C0F1 390 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL22Q9GZX6 179 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACSS2Q9NR19 701 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRK3P35626 688 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRKAA2P54646 552 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FUT2Q10981 343 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 INAQ16352 499 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 UTS2BQ765I0 119 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 BTRCQ9Y297 605 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A087WXM4 84 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 IRF6O14896 467 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFN2O95140 757 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TFEBP19484 476 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GSTT1P30711 240 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 OAZ1P54368 228 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRC38Q5VT99 294 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FFAR3O14843 346 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPR42O15529 346 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NBNO60934 754 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDH8O95206 1070 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ETS2P15036 469 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSEN2P49810 448 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HK2P52789 917 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAXP61244 160 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 VAT1Q99536 393 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 AAASQ9NRG9 546 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARL15Q9NXU5 204 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB14P61106 215 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LBPP18428 481 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TYMPP19971 482 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP3A7P24462 503 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCID2Q5JVF3 399 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TERB1Q8NA31 727 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPTCQ9UBM4 332 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLDN5O00501 218 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CXCL11O14625 94 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ITGAVP06756 1048 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ITGA2BP08514 1039 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSME3P61289 254 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLCL1Q15111 1095 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRABD2AQ86V40 505 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RCN3Q96D15 328 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EXOC2Q96KP1 924 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANPEPP15144 967 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL2P60568 153 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCEA2Q15560 299 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.48□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms