RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAI1Q9UI46 699 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 FZD4Q9ULV1 537 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A087X0T9 212 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 C4orf47A7E2U8 309 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 K7ERQ8 282 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 TM4SF5O14894 197 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 MCF2LO15068 1137 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ALOX15BO15296 676 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 BNIP3LO60238 219 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM228BP0C875 321 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 GNSP15586 552 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ACVRL1P37023 503 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ETFBP38117 255 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 CLCN6P51797 869 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ARF5P84085 180 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 SEMA3BQ13214 749 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 RETSATQ6NUM9 610 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 EPAS1Q99814 870 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 FSCN3Q9NQT6 498 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP5-201ENST00000366391 CREB3O43889 395 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF8O76064 485 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 GOT1P17174 413 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 EPHB2P29323 1055 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC20A2Q08357 652 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM14Q14142 442 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 C22orf39Q6P5X5 142 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SNX19Q92543 992 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 MAGEH1Q9H213 219 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SARDHQ9UL12 918 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1B0GTW7 788 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 RAMP2O60895 175 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 DRD3P35462 400 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPK8P45983 427 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 METAP1P53582 386 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 GALCP54803 685 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM46CQ5VWP2 391 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 VSTM4Q8IW00 320 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 OR2A12Q8NGT7 310 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 C1orf216Q8TAB5 229 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 BIRC7Q96CA5 298 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC114Q96M63 670 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PEBP4Q96S96 227 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PPM1HQ9ULR3 514 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM47DPA6NHR8 397 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGAP33O14559 1287 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 LRCH4O75427 683 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 FSBPO95073 299 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CD160O95971 181 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SYPP08247 313 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 MIPP30301 263 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA0895LQ68EN5 471 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 NCEH1Q6PIU2 408 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 OR2T34Q8NGX1 318 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CEP44Q9C0F1 390 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 THAP2Q9H0W7 228 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 TNKS2Q9H2K2 1166 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 NENFQ9UMX5 172 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 ACTL7AQ9Y615 435 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC72A6NJI9 287 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 WASH4PA8MWX3 477 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PLK4O00444 970 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms