RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 TSC1Q92574 1164 aa21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 DMTF1Q9Y222 760 aa21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SOCS1-201ENST00000332029 FAM170AA1A519 330 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ALOX15BO15296 676 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CDH4P55283 916 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 DEUP1Q05D60 604 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CNTN1Q12860 1018 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 DLG2Q15700 870 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 AGBL4Q5VU57 503 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 IQCHQ86VS3 1027 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM69Q86WT6 500 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TBCBQ99426 244 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 VPS16Q9H269 839 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM51Q9NW97 253 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 VPS28Q9UK41 221 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 I6L893 689 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEC1O60732 1142 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 MMEP08473 750 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF18P17022 549 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 OVGP1Q12889 678 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 C2CD6Q53TS8 623 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 HES3Q5TGS1 186 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 Q6ZVU0 165 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 GANQ9H2C0 597 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.63■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 MCF2LO15068 1137 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CNTN5O94779 1100 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 FLT3P36888 993 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 NOMO3P69849 1222 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 STAT4Q14765 748 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 KRT31Q15323 416 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ALFQ53S48 1182 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 NAA35Q5VZE5 725 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CRELD1Q96HD1 420 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf74Q96LT6 269 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 MUC3BQ9H195 1237 aa21.62■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 DRGXA6NNA5 263 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 BNIP3LO60238 219 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TPM2P07951 284 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 RHOCP08134 193 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CKMT2P17540 419 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ABCG1P45844 678 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 KLK7P49862 253 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ILKQ13418 452 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC31Q6UY01 552 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF677Q86XU0 584 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 PREBQ9HCU5 417 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.61■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 KNTC1P50748 2209 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 GFPT2O94808 682 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 MBD3O95983 291 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 KRT83P78385 493 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TRNP1Q6NT89 227 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 ARCQ7LC44 396 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CA5BQ9Y2D0 317 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 AK5Q9Y6K8 562 aa21.6■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.59■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SDC3O75056 442 aa21.59■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SRCP12931 536 aa21.59■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 SOX5P35711 763 aa21.59■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 TAS2R38P59533 333 aa21.59■■□□□ 1.05
SOCS1-201ENST00000332029 CDR2Q01850 454 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms