RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CDT1Q9H211 546 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DEFB106AQ8N104 65 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 POMKQ9H5K3 350 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.55■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CCDC166P0CW27 439 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 UGT1A6P19224 532 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 HMOX2P30519 316 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 GPD2P43304 727 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NRBF2Q96F24 287 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NAT9Q9BTE0 207 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DTLQ9NZJ0 730 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 VILLO15195 856 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 STMN1P16949 149 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PCYT1AP49585 367 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 OCA2Q04671 838 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 KBTBD6Q86V97 674 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CBR4Q8N4T8 237 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 MAML3Q96JK9 1138 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 TBCBQ99426 244 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CROTQ9UKG9 612 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DSEQ9UL01 958 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 TRIM38O00635 465 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 WNT10BO00744 389 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CD1EP15812 388 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PTPN7P35236 360 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 RABGGTBP53611 331 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 INPP5AQ14642 412 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 MAPRE2Q15555 327 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.54■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 HCRTO43612 131 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 SLC5A2P31639 672 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 GRM3Q14832 879 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 LHX5Q9H2C1 402 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 A0A087WXM4 84 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 BAIAP3O94812 1187 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CDH13P55290 713 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 BNIP3Q12983 259 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 POTEHQ6S545 545 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 AHI1Q8N157 1196 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 LZICQ8WZA0 190 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 H6PDO95479 791 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 FUT4P22083 530 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 ADIGQ0VDE8 80 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DLG3Q92796 817 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 FAM167AQ96KS9 214 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PNPLA3Q9NST1 481 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 GID8Q9NWU2 228 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 PPME1Q9Y570 386 aa15.53■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 NR1D2Q14995 579 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 CYP51A1Q16850 503 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 DCAF15Q66K64 600 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 MAVSQ7Z434 540 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 COPS5Q92905 334 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.52■□□□□ 0.08
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PPW3 197 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms