RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 PNMA5Q96PV4 448 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 PLIN2Q99541 437 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 IER2Q9BTL4 223 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ANO3Q9BYT9 981 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM206Q9H813 350 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 VWA7Q9Y334 891 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 COL4A5P29400 1685 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 KPNA6O60684 536 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 HLCSP50747 726 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 RHAGQ02094 409 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 VAC14Q08AM6 782 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM32Q13049 653 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TRPC3Q13507 836 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DDR2Q16832 855 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 AGAP6Q5VW22 663 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 WDR49Q8IV35 697 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 HIPK4Q8NE63 616 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FRS2Q8WU20 508 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 APBB2Q92870 758 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 HDAC11Q96DB2 347 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 AGAP4Q96P64 663 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 PAFAH2Q99487 392 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 CD320Q9NPF0 282 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 CD93Q9NPY3 652 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 CREBZFQ9NS37 354 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DTLQ9NZJ0 730 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF221Q9UK13 617 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 E7ESA3 106 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 CLDN3O15551 220 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ACSL4O60488 711 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 PEX10O60683 326 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 UGT2B11O75310 529 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FGRP09769 529 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 OR52Z1P0C646 297 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT10P13645 584 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 AKR1B1P15121 316 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 PTGER2P43116 358 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 MAP3K7CLP57077 242 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TMPRSS15P98073 1019 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FLOT2Q14254 428 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC36A3Q495N2 470 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 IGSF11Q5DX21 431 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 RAD54LQ92698 747 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 E2F7Q96AV8 911 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 IL12RB2Q99665 862 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 BTBD2Q9BX70 525 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 CTDSP2O14595 271 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF195O14628 629 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ADAM11O75078 769 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF623O75123 536 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 ATG13O75143 517 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAJB5O75953 348 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5F1O95221 314 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 PCNAP12004 261 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF2E1-201ENST00000283875 BMP4P12644 408 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms