RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 SESN3P58005 492 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGAP8P85298 464 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MPP3Q13368 585 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ATG16L1Q676U5 607 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RPAINQ86UA6 219 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM136AQ96C01 138 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RBBP8Q99708 897 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NT5MQ9NPB1 228 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RGS18Q9NS28 235 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 39.6
SLC20A1-201ENST00000272542 GSTA2P09210 222 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM163BP0C2L3 166 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DUSP4Q13115 394 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRCAPQ14761 206 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RASIP1Q5U651 963 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 VPS39Q96JC1 886 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1W2PQY0 241 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NCAM2O15394 837 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GYG2O15488 501 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DIAPH2O60879 1101 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NBNO60934 754 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 AHSGP02765 367 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PIRTP0C851 137 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TAF10Q12962 218 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 IGSF8Q969P0 613 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DSEQ9UL01 958 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ZMPSTE24O75844 475 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MAVSQ7Z434 540 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ABI1Q8IZP0 508 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PSMG2Q969U7 264 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 HMCESQ96FZ2 354 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 COPG2Q9UBF2 871 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 KRT34O76011 436 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PROCP04070 461 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 AIF1P55008 147 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CDH17Q12864 832 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GPNMBQ14956 572 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF135Q8IUD6 432 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP93Q8N1F7 819 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 URGCPQ8TCY9 931 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 IRGQQ8WZA9 623 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NSL1Q96IY1 281 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 NDNQ99608 321 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CPNE1Q99829 537 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SRRDQ9UH36 339 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO7AQ13402 2215 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 B2RBV5 119 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ADAM12O43184 909 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CHRNGP07510 517 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CCL23P55773 120 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DSC1Q08554 894 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RTP2Q5QGT7 225 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MFSD6LQ8IWD5 586 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GLOD4Q9HC38 313 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 USP1O94782 785 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPN4P29074 926 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 KCNQ1P51787 676 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TBL1YQ9BQ87 522 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 RRN3Q9NYV6 651 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms