RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.01□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 MLYCDO95822 493 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 IGFALSP35858 605 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 MTTPP55157 894 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SCRN3Q0VDG4 424 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 TSGA10IPQ3SY00 556 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 VPS4AQ9UN37 437 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ERBB3P21860 1342 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 GSG1L2A8MUP6 293 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ZNF432O94892 652 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ARL3P36405 182 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 IRGCQ6NXR0 463 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ATG14Q6ZNE5 492 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 KAT5Q92993 513 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CD101Q93033 1021 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 UBOX5O94941 541 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PDHA2P29803 388 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 DENND5AQ6IQ26 1287 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 BRSK2Q8IWQ3 736 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ANKRD7Q92527 254 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SPG21Q9NZD8 308 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 DNPEPQ9ULA0 475 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 XYLBO75191 536 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 RFX4Q33E94 735 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 GPAT3Q53EU6 434 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ACOT1Q86TX2 421 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ARL15Q9NXU5 204 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CHST10O43529 356 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 KLRC1P26715 233 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 AMHR2Q16671 573 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 KLHL32Q96NJ5 620 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 UPB1Q9UBR1 384 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 OR5F1O95221 314 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CCNYL3P0C7X3 344 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CDH4P55283 916 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 MPZL3Q6UWV2 235 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PIGBQ92521 554 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 TMEM121Q9BTD3 319 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ADGRL2O95490 1459 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 MYH7P12883 1935 aa12□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 IFNA16P05015 189 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 AKAP14Q86UN6 197 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 GMIPQ9P107 970 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 EFR3AQ14156 821 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CGRRF1Q99675 332 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PLIN3O60664 434 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 NR2F6P10588 404 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CDH3P22223 829 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 MAGEA2P43356 314 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 MYL6P60660 151 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CCZ1BP86790 482 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 BCL2L1Q07817 233 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 TAF5Q15542 800 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 HYIQ5T013 277 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 VAT1Q99536 393 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 POTEHQ6S545 545 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SERPINB11Q96P15 392 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 PSMD13Q9UNM6 376 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 DHRS7Q9Y394 339 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 CATP04040 527 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 DCLK3Q9C098 648 aa11.99□□□□□ -0.49
GREB1-201ENST00000234142 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms