RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CSRP3P50461 194 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CDKL1Q00532 357 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 TSPAN14Q8NG11 270 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 RIN3Q8TB24 985 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 UNCXA6NJT0 531 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 C8BP07358 591 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP2C9P11712 490 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GOT1P17174 413 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 EMP3P54852 163 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP1Q07960 439 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GRID2O43424 1007 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GJB1P08034 283 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MPSTP25325 297 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 LAMC2Q13753 1193 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR162Q16538 588 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 UNC93AQ86WB7 457 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 AGAP3Q96P47 875 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 FZD10Q9ULW2 581 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 RAD54BQ9Y620 910 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MFSD11O43934 449 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 H6PDO95479 791 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 COL6A2P12110 1019 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ACADSBP45954 432 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CLCN3P51790 818 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP2R5DQ14738 602 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CCL15Q16663 113 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC185Q8N715 623 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 HM13Q8TCT9 377 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GABBR2O75899 941 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 AP2A1O95782 977 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 EPHA3P29320 983 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GTF2A2P52657 109 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MPP3Q13368 585 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ANO4Q32M45 955 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF567Q8N184 647 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 EME1Q96AY2 570 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PLXNB2O15031 1838 aa23.2■■□□□ 1.31
ANKRD54-201ENST00000215941 PIGNO95427 931 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIA4P48058 902 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PKNOX1P55347 436 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 IGBP1P78318 339 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 GK3PQ14409 553 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 CARM1Q86X55 608 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL32Q96NJ5 620 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 CCT7Q99832 543 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 VTA1Q9NP79 307 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 CASS4Q9NQ75 786 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PNPLA3Q9NST1 481 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PACSIN3Q9UKS6 424 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 TRPC5OSA6NMA1 111 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 AP3B1O00203 1094 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 CFLARO15519 480 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 DDHD2O94830 711 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 VAPBO95292 243 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 LTFP02788 710 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 CHRNGP07510 517 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PCSK6P29122 969 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-201ENST00000215941 POLD2P49005 469 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms