RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scn1aA2APX8 2009 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm13941A2AJ38 245 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hoxb8P09632 243 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc2a4P14142 509 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pou4f1P17208 421 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 ThraP63058 492 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Aarsd1Q3THG9 412 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vps51Q3UVL4 782 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mpzl3Q3V3F6 237 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 GpamQ61586 827 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tbc1d12Q6A039 696 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fastkd1Q6DI86 829 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tdpoz3Q717B4 365 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 FsbpQ8BKE5 299 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ifi205aQ8CGE8 404 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mkl1Q8K4J6 964 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Myoz3Q8R4E4 245 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp566Q8VCI1 386 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Isl2Q9CXV0 359 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Aqp5Q9WTY4 265 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf536Q8K083 1302 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zbed5B2RPU8 756 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf19aP50636 840 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 ScinQ60604 715 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 RadilQ69Z89 1099 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5414Q6IFZ8 552 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Krt73Q6NXH9 539 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1105Q7TR58 312 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Aph1bQ8C7N7 257 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nox1Q8CIZ9 591 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Unc93b1Q8VCW4 598 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scamp5Q9JKD3 235 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc4-201ENSMUST00000020258 TankP70347 448 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atp5jP97450 108 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Aqp1Q02013 269 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Afg1lQ3V384 480 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arhgap1Q5FWK3 439 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Casc4Q6P2L7 435 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr798Q7TRH8 311 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr533Q7TRT7 320 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gprc5aQ8BHL4 356 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Borcs5Q9D920 195 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ddx59Q9DBN9 619 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ap4s1Q9WVL1 144 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 ApipQ9WVQ5 241 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5751A2AHC8 147 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ssxb8B1AY40 170 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 NuggcD3YWJ0 796 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pold2O35654 469 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cldn5O54942 218 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Prim2P33610 505 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Elk4P41158 430 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 GsrP47791 500 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 PfkmP47857 780 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 SPINDOCQ05AH6 381 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q3KNL4 93 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Podnl1Q6P3Y9 559 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Stk32aQ8BGW6 398 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Panx3Q8CEG0 392 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxw7Q8VBV4 629 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pgm3Q9CYR6 542 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdyl2Q9D5D8 503 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mpp6Q9JLB0 553 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ubr3Q5U430 1889 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trip11E9Q512 1976 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r2A2AMT6 306 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccdc62E9PVD1 701 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hes2O54792 157 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tpst1O70281 370 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Timm13P62075 95 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vps45P97390 570 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm1604bQ3TRG0 118 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Plcl1Q3USB7 1096 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 UrgcpQ5NCI0 926 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klra8Q60682 266 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ecm1Q61508 559 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sort1Q6PHU5 825 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 SowahcQ8C0J6 512 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccdc63Q8CDV6 558 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Celf3Q8CIN6 465 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ablim1Q8K4G5 861 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tspan14Q8QZY6 270 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ankrd49Q8VE42 238 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppa2Q91VM9 330 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc4-201ENSMUST00000020258 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.2 ms