RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr33Q8C494 260 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HpdlQ8K248 371 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Otud7aQ8R554 926 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef3Q91X46 524 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DdoQ922Z0 341 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Katnal2Q9D3R6 539 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd4Q9D7X1 259 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Extl1Q9JKV7 669 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp11cQ9QZW0 1129 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tagln3Q9R1Q8 199 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 S1pr4Q9Z0L1 386 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC024978J3QPC3 361 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r44L7N2E1 861 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alox15P39654 663 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plk2P53351 682 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dpf3P58269 378 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Deup1Q7M6Y5 601 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TdrkhQ80VL1 560 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pnma2Q8BHK0 365 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mapkap1Q8BKH7 522 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rap2cQ8BU31 183 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B4galt3Q91YY2 395 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dok4Q99KE3 325 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lysmd3Q99LE3 305 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acot13Q9CQR4 140 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Borcs5Q9D920 195 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmod3Q9JHJ0 352 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NuggcD3YWJ0 796 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr603L7N1Y4 312 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pgk2P09041 417 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aarsd1Q3THG9 412 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr174Q3U507 335 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Agap2Q3UHD9 1186 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TceancQ3US16 359 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr464Q5SW48 313 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rasa4Q6PFQ7 802 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf168Q80XJ2 565 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Disc1Q811T9 852 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam204aQ8C6C7 236 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pex19Q8VCI5 299 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Reep3Q99KK1 254 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr3eQ9CZT4 710 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il17rbQ9JIP3 499 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PolkQ9QUG2 852 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bmp15Q9Z0L4 392 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam81bA0A140LI28 432 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp963D3Z2T8 383 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm28043E0CXC2 719 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chrna4O70174 629 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TnfP06804 235 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lamp2P17047 415 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atxn10P28658 475 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mxd1P50538 227 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adrbk2Q3UYH7 688 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcg2Q7TMS5 657 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sel1l3Q80TS8 1137 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc41a1Q8BJA2 512 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RtknQ8C6B2 564 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cog4Q8R1U1 785 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ClmpQ8R373 373 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GldcQ91W43 1025 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q922R1 422 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il20Q9JKV9 176 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Egfl7Q9QXT5 275 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RpgrQ9R0X5 1001 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pramef17A2ASJ1 475 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2j12G3UXT0 502 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf683I7HJS4 458 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AldoaP05064 364 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AladP10518 330 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P3h1Q3V1T4 739 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ckap2lQ7TS74 745 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zmiz2Q8CIE2 920 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Timd2Q8R183 305 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chrnb2Q9ERK7 501 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tle2Q9WVB2 767 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh2d4bA6X942 431 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B020004C17RikJ3QP07 232 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rdh7O88451 316 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sbk3P0C5K0 361 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gnao1P18872 354 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ThraP63058 492 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TankP70347 448 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MyrfQ3UR85 1138 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pqlc1Q80XM9 271 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ano4Q8C5H1 955 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asb14Q8C6Y6 587 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.3 ms