RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	WDR47	O94967	919 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SLC7A2	P52569	658 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	IMPG1	Q17R60	797 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	AKAP14	Q86UN6	197 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	OR8H2	Q8N162	312 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MYL6	P60660	151 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	IL5RA	Q01344	420 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CCNI	Q14094	377 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NDUFA5	Q16718	116 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	IL23R	Q5VWK5	629 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	RORB	Q92753	470 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ATG4C	Q96DT6	458 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	APBA2	Q99767	749 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	PFDN6	O15212	129 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	HMGCR	P04035	888 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	KLRC2	P26717	231 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	RXRG	P48443	463 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	GK5	Q6ZS86	529 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MAGED4	Q96JG8	741 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SCN3B	Q9NY72	215 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	DGAT1	O75907	488 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	AOC1	P19801	751 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CRHR1	P34998	444 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NFIL3	Q16649	462 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	DGUOK	Q16854	277 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	BROX	Q5VW32	411 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TMEM198	Q66K66	360 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SNED1	Q8TER0	1413 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	VPS51	Q9UID3	782 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ZNF536	O15090	1300 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SH3BP5	O60239	455 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MYO1D	O94832	1006 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CLIC3	O95833	236 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SLC5A2	P31639	672 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CAP2	P40123	477 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CD97	P48960	835 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NFYC	Q13952	458 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SNX31	Q8N9S9	440 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CD101	Q93033	1021 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CDH19	Q9H159	772 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MARCH7	Q9H992	704 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	FBXO40	Q9UH90	709 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	COL4A5	P29400	1685 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	LCP1	P13796	627 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ZNF24	P17028	368 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	ALDH4A1	P30038	563 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	UBR7	Q8N806	425 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	NAT16	Q8N8M0	369 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	OMD	Q99983	421 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PXN-222	ENST00000637624	UBP1	Q9NZI7	540 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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