RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX5	P35711	763 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GCNT1	Q02742	428 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CREM	Q03060	361 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC6	Q16204	474 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ITIH5	Q86UX2	942 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BBS5	Q8N3I7	341 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GAB3	Q8WWW8	586 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CHP1	Q99653	195 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HGH1	Q9BTY7	390 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF38	Q9H0F5	515 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK12	Q9HB15	430 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CLUH	O75153	1309 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ANTXRL	A6NF34	631 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CHN1	P15882	459 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP13	P45452	471 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GALK1	P51570	392 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BCAT1	P54687	386 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RELA	Q04206	551 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP4X1	Q8N118	509 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NOX5	Q96PH1	765 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC7	Q99615	494 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP16	Q9BY84	665 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	STK33	Q9BYT3	514 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ISCU	Q9H1K1	167 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MKS1	Q9NXB0	559 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO10	Q9HD67	2058 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP8B3	O60423	1300 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM24	O15164	1050 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K7	O43318	606 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBED1	O96006	694 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RARG	P13631	454 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ETS2	P15036	469 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	AP1B1	Q10567	949 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	IL23R	Q5VWK5	629 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CROCCP2	Q86T23	111 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC93A	Q86WB7	457 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SHC3	Q92529	594 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMG2	Q969U7	264 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	OSER1	Q9NX31	292 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	COG5	Q9UP83	839 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GBF1	Q92538	1859 aa		7.4	□□□□□ -1.23

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