RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NLRP4Q96MN2 994 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MUC3BQ9H195 1237 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 COG4Q9H9E3 785 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SQORQ9Y6N5 450 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PCM1Q15154 2024 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF839A8K0R7 811 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZBBXA8MT70 800 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MAN1A2O60476 641 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ALDH4A1P30038 563 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 BMPR1AP36894 532 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ABCG1P45844 678 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA13P48723 471 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 OXA1LQ15070 435 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 LIN9Q5TKA1 542 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM270Q6UE05 265 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB33Q86T24 672 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TTC30AQ86WT1 665 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 DTX3Q8N9I9 347 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KYQ8NBH2 561 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SUN5Q8TC36 379 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SGCDQ92629 289 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MCEEQ96PE7 176 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SORT1Q99523 831 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 WDR41Q9HAD4 459 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SMOXQ9NWM0 555 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 AP4S1Q9Y587 144 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CEP290O15078 2479 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 HMX2A2RU54 273 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ADM5C9JUS6 153 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PSTPIP1O43586 416 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 JRKO75564 520 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SPAG6O75602 509 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 BMP10O95393 424 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 HDCP19113 662 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ADORA2AP29274 412 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 COPZ1P61923 177 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2BQ00403 316 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TNK2Q07912 1038 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MBLAC2Q68D91 279 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 FAM160B2Q86V87 743 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RMDN3Q96TC7 470 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINI1Q99574 410 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 APBA2Q99767 749 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PPCSQ9HAB8 311 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 COL4A5P29400 1685 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 WDR64B1ANS9 1081 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TEX28O15482 410 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CLOCKO15516 846 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 AKAP10O43572 662 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CCNA2P20248 432 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PRKACBP22694 351 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ME2P23368 584 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 LIG4P49917 911 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PGGT1BP53609 377 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 WNT7BP56706 349 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 OGDHQ02218 1023 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ART3Q13508 389 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PTK2BQ14289 1009 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TAF5Q15542 800 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MTERF2Q49AM1 385 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PIGGQ5H8A4 983 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf22Q6V702 233 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.34□□□□□ -1.07
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