RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	VPS51	Q9UID3	782 aa		27.61	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315		A0A0D9SEW6	157 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	PATE3	B3GLJ2	98 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	CBX4	O00257	560 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ATP9B	O43861	1147 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	BNIP3L	O60238	219 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	LRIG2	O94898	1065 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ADH1B	P00325	375 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	IL1B	P01584	269 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	PSMD8	P48556	350 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	MAPKAPK2	P49137	400 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	GNA12	Q03113	381 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	USP30	Q70CQ3	517 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	OR7D4	Q8NG98	312 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ISCU	Q9H1K1	167 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	CEP250	Q9BV73	2442 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	MID1	O15344	667 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	CREB3	O43889	395 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SNAP91	O60641	907 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	L1CAM	P32004	1257 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SLC8A1	P32418	973 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SNX19	Q92543	992 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	PSMB7	Q99436	277 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	DNAI1	Q9UI46	699 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FZD10	Q9ULW2	581 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FAM72C	H0Y354	149 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SLC30A4	O14863	429 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SEMA4F	O95754	770 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	EPHB2	P29323	1055 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ACSL1	P33121	698 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	CLCN6	P51797	869 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	LIMK1	P53667	647 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	IRX4	P78413	519 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	STPG1	Q5TH74	334 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FAM72B	Q86X60	149 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FRS2	Q8WU20	508 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	FAM129B	Q96TA1	746 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BRD4-208	ENST00000597315	LNP1	A1A4G5	178 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	METTL12	A8MUP2	240 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	C7	P10643	843 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	SRC	P12931	536 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	VAV1	P15498	845 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	C5AR1	P21730	350 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	OGDH	Q02218	1023 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	SLC20A2	Q08357	652 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315		Q6ZVU0	165 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		27.57	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315		A0A1W2PP55	124 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	PRPSAP2	O60256	369 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	RAMP2	O60895	175 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	SERPINF2	P08697	491 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	MAOB	P27338	520 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	LINGO4	Q6UY18	593 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	MAGEH1	Q9H213	219 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DEF6	Q9H4E7	631 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DONSON	Q9NYP3	566 aa		27.56	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	LRRC72	A6NJI9	287 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ALOX15B	O15296	676 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	MT-CO1	P00395	513 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		27.55	■■■□□ 2
BRD4-208	ENST00000597315	NLRP14	Q86W24	1093 aa		27.55	■■■□□ 2

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