RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 GNA14O95837 355 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R38P59533 333 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RFFLQ8WZ73 363 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST4Q9Y661 456 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOX15BO15296 676 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 BNIP3LO60238 219 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 GLI1P08151 1106 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ACP1P24666 158 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MORC3Q14149 939 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D3CQ8N5H7 860 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOCQ99972 504 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS28Q9UK41 221 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 BIN1O00499 593 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC6O43699 453 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 BRINP1O60477 761 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 HSF2BPO75031 334 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSLP07711 333 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF18P17022 549 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 GLDCP23378 1020 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 APBA1Q02410 837 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 NME3Q13232 169 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf80Q86SX3 495 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PASD1Q8IV76 773 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A45Q8N413 288 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM145Q8NBT3 493 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CRACR2AQ9BSW2 395 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CAAP1Q9H8G2 361 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PREBQ9HCU5 417 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP8O43159 456 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PRLRP16471 622 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK1Q13153 545 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM65Q6PJ69 517 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK6Q92876 244 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC7BQ96G42 594 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGE1O75459 146 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QL1O75973 258 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-CO1P00395 513 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SRCP12931 536 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 USP8P40818 1118 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP44Q17R89 818 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 EFHC1Q5JVL4 640 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFML1Q6UWY5 402 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 BAP1Q92560 729 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB7Q99436 277 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD3Q9NPG1 666 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST2Q9Y278 367 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQU0 124 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ERQ8 282 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF103O00237 685 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC31A1O15431 190 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN11O75508 207 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTN5O94779 1100 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ERBB2P04626 1255 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 THEGLP0DJG4 465 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKAP23743 735 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf22Q49AR2 442 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A7Q92504 469 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRDC3Q96B67 414 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC3BQ9H195 1237 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ANLNQ9NQW6 1124 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAP91O60641 907 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 DAB1O75553 588 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A1P19634 815 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNMA1Q12791 1236 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF284Q2VY69 593 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM7AQ6ZMT4 941 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A12Q8NGT7 310 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C6Q8NH72 309 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF11Q92914 225 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 SIK2Q9H0K1 926 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-211ENST00000590874 BPTFQ12830 3046 aa26.28■■□□□ 1.8
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