RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584439.1

CTC1-212, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 4

Gene CTC1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-212ENST00000584439 GSX2Q9BZM3 304 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 KIF3AQ9Y496 699 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 MTORP42345 2549 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 A0A096LPE4 126 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 A0A1W2PPZ6 126 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 F5H423 210 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 VILLO15195 856 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CLDN3O15551 220 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SIGLEC6O43699 453 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 NOBOXO60393 691 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SASH3O75995 380 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 RHOBTB3O94955 611 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CLTAP09496 248 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 JMJD7P0C870 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 IRF1P10914 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TYRP14679 529 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SYT1P21579 422 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PRKCHP24723 683 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CD27P26842 260 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 OXTRP30559 389 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 DCTP40126 519 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 UQCRFS1P47985 274 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CASP5P51878 434 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 ILKQ13418 452 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 USP53Q70EK8 1073 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 METTL23Q86XA0 190 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 MYCT1Q8N699 235 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 FSIP1Q8NA03 581 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 OR13H1Q8NG92 308 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 STK35Q8TDR2 534 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 BHMTQ93088 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TNIP3Q96KP6 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 USP28Q96RU2 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PARVGQ9HBI0 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 THSD1Q9NS62 852 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PLK2Q9NYY3 685 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 MTMR6Q9Y217 621 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 A0A1B0GVM2 712 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 A0A1W2PR77 199 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 GFRA2O00451 464 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 OGTO15294 1046 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 COCHO43405 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CACNG3O60359 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 MMP20O60882 483 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SDC3O75056 442 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PPFIA2O75334 1257 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 MAP3K6O95382 1288 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SEMA4FO95754 770 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 TNFAIP3P21580 790 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 DDIT3P35638 169 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 UBA7P41226 1012 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 ACOT2P49753 483 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PGFP49763 221 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 LIG4P49917 911 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 CACNA2D1P54289 1103 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 C21orf59P57076 290 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 RELBQ01201 579 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SLC7A5Q01650 507 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 SMARCB1Q12824 385 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 ENPP2Q13822 863 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 KRT72Q14CN4 511 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 GEN1Q17RS7 908 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-212ENST00000584439 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.49□□□□□ -1.37
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