RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 BMPR2Q13873 1038 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 NFYCQ13952 458 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 POU6F1Q14863 301 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TRIP10Q15642 601 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 XKR3Q5GH77 459 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MCUBQ9NWR8 336 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 INVSQ9Y283 1065 aa8.58□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CRTAMO95727 393 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 NR3C2P08235 984 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 OR56A5P0C7T3 313 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SLC2A3P11169 496 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 COX7A2P14406 83 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GPR15P49685 360 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 DEFA1P59665 94 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 DEFA3P59666 94 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 NR6A1Q15406 480 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MYH3P11055 1940 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 KPNA6O60684 536 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SEC22BO75396 215 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 RGS20O76081 388 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PGM3O95394 542 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 LPAL2Q16609 132 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CES3Q6UWW8 571 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TTC7BQ86TV6 843 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SATL1Q86VE3 508 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 L1RE1Q9UN81 338 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MYH10P35580 1976 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 KMOO15229 486 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 EXTL3O43909 919 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GNRH1P01148 92 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ERCC2P18074 760 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CASP6P55212 293 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 C16orf89Q6UX73 402 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 AKT1S1Q96B36 256 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MARK4Q96L34 752 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TBX20Q9UMR3 447 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 RGS1Q08116 209 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GRB10Q13322 594 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SP8Q8IXZ3 490 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PPLO60437 1756 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 FAM92AA1XBS5 289 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 A8MUA0 341 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 H3BQF6 201 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ARP10275 920 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 NCK1P16333 377 aa8.57□□□□□ -1.04
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PDPR-210ENST00000568530 TBX4P57082 545 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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PDPR-210ENST00000568530 CRELD1Q96HD1 420 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SEPHS2Q99611 448 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CDH9Q9ULB4 789 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 A8MUI8 341 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 BGNP21810 368 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SCNN1GP51170 649 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 IL5RAQ01344 420 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TDRPQ86YL5 185 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.57□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 ARMC5Q96C12 935 aa8.57□□□□□ -1.04
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