RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa23.05■■□□□ 1.28
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CLN3-215ENST00000565236 BNIP3LO60238 219 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-215ENST00000565236 PROS1P07225 676 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-215ENST00000565236 C1QTNF9P0C862 333 aa23.05■■□□□ 1.28
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CLN3-215ENST00000565236 ADPRHP54922 357 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-215ENST00000565236 ATP11AP98196 1134 aa23.05■■□□□ 1.28
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CLN3-215ENST00000565236 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.05■■□□□ 1.28
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CLN3-215ENST00000565236 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.05■■□□□ 1.28
CLN3-215ENST00000565236 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.05■■□□□ 1.28
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CLN3-215ENST00000565236 CNTN1Q12860 1018 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN3-215ENST00000565236 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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CLN3-215ENST00000565236 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN3-215ENST00000565236 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN3-215ENST00000565236 PNPLA1Q8N8W4 532 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN3-215ENST00000565236 OR7D4Q8NG98 312 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN3-215ENST00000565236 FAM131CQ96AQ9 280 aa23.01■■□□□ 1.27
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