RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CALM1	P0DP23	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CALM2	P0DP24	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CALM3	P0DP25	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	IDE	P14735	1019 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC16A2	P36021	539 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RCAN1	P53805	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	BACE1	P56817	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TIRAP	P58753	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FHL3	Q13643	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RAB30	Q15771	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PRRX2	Q99811	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087X1B8	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	AP4M1	O00189	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PSMD9	O00233	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CPLX1	O14810	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FFAR2	O15552	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SNX2	O60749	519 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	NXPH3	O95157	252 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ONECUT2	O95948	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	IFNAR1	P17181	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ENG	P17813	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PROZ	P22891	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GJB2	P29033	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PCSK6	P29122	969 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CXCR5	P32302	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	KIF5B	P33176	963 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2C18	P33260	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DDIT3	P35638	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC1A4	P43007	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GNAQ	P50148	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SNAP25	P60880	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP1B	P68106	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PPAT	Q06203	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PKP1	Q13835	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ELF2	Q15723	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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