RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CBX4O00257 560 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 NDUFS2O75306 463 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PROSCO94903 275 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 C7P10643 843 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARL4AP40617 200 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGAP25P42331 645 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAGEA1P43355 309 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PTPRN2Q92932 1015 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PEBP4Q96S96 227 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 NEU3Q9UQ49 428 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.5■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNAP91O60641 907 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 LCA5LO95447 670 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 NUMBP49757 651 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CA9Q16790 459 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PARP15Q460N3 678 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PMS2CLQ68D20 193 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RFFLQ8WZ73 363 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.49■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CKAP5Q14008 2032 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 H3BRJ5 948 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRP3O75074 770 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RARAP10276 462 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SRCP12931 536 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD6P30203 668 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAN1A1P33908 653 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 DPP6P42658 865 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 TPMTP51580 245 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 NDST2P52849 883 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCEAL1Q15170 157 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 DPYSL2Q16555 572 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RFX8Q6ZV50 586 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 FRS2Q8WU20 508 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSPH1Q92598 858 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP44Q9C0F1 390 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MTG2Q9H4K7 406 aa21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ALOX15BO15296 676 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 KDELR3O43731 214 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MTA2O94776 668 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 EPN2O95208 641 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT7P08729 469 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 FECHP22830 423 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 IL1R2P27930 398 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 LZTR1Q8N653 840 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 DMDP11532 3685 aa21.47■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZMPSTE24O75844 475 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ADH1BP00325 375 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MT-CO1P00395 513 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 IGLV3-19P01714 112 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 GOT1P17174 413 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ERCC2P18074 760 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 BCKDHBP21953 392 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 ACVRL1P37023 503 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT81Q14533 505 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MESDQ14696 234 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP30Q70CQ3 517 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 STK40Q8N2I9 435 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPC24Q8NBT2 197 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 GANCQ8TET4 914 aa21.46■■□□□ 1.03
ADAMTS17-205ENST00000558960 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms