RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 KLC2Q9H0B6 622 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-220ENST00000550700 RAB17Q9H0T7 212 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-220ENST00000550700 SP110Q9HB58 689 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-220ENST00000550700 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-220ENST00000550700 VPS28Q9UK41 221 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-220ENST00000550700 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-220ENST00000550700 A0A0A0MRY4 1105 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 SMAPO00193 183 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ARNTLO00327 626 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 OPHN1O60890 802 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MCM3P25205 808 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GJA4P35212 333 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GRIA2P42262 883 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 DR1Q01658 176 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TNK2Q07912 1038 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ADCY2Q08462 1091 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 AP1B1Q10567 949 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GRM2Q14416 872 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 P3H1Q32P28 736 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ARTNQ5T4W7 220 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MARC1Q5VT66 337 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.51□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 ALLCQ8N6M5 410 aa9.51□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 HMCESQ96FZ2 354 aa9.51□□□□□ -0.89
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