RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CEP170P1Q96L14 293 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HMG20AQ9NP66 347 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 EBF1Q9UH73 591 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 VAV3Q9UKW4 847 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CPQQ9Y646 472 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM38O00635 465 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NCAM2O15394 837 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 DNAJB5O75953 348 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NFIAQ12857 509 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GRIK5Q16478 980 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 LILRA2Q8N149 483 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ENKURQ8TC29 256 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ATP2A3Q93084 1043 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MAGED4Q96JG8 741 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 APOL6Q9BWW8 343 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.99□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 LILRB3O75022 631 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CLPXO76031 633 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KRT75O95678 551 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CCNA2P20248 432 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 NME5P56597 212 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TAZQ16635 292 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 Q3ZCU0 254 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MSS51Q4VC12 460 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 BBS12Q6ZW61 710 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CNTD1Q8N815 330 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SNX31Q8N9S9 440 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 HIPK4Q8NE63 616 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CLPBQ9H078 707 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TK2O00142 265 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ATE1O95260 518 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 BCL10O95999 233 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 C1QAP02745 245 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 SREBF1P36956 1147 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 GCLMP48507 274 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 MAMLD1Q13495 774 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ATP1A4Q13733 1029 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 PTK2BQ14289 1009 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 EPGNQ6UW88 154 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CDH26Q8IXH8 852 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 FLCNQ8NFG4 579 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TFAP2CQ92754 450 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CPVLQ9H3G5 476 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CACNG2Q9Y698 323 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 CLDN25C9JDP6 229 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF195O14628 629 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 ACOT8O14734 319 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 AXIN1O15169 862 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 TFPTP0C1Z6 253 aa8.98□□□□□ -0.97
GPBP1-208ENST00000514387 KITP10721 976 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms