RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 HS3ST2Q9Y278 367 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF103O00237 685 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 BNIP3LO60238 219 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA4FO95754 770 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 GZMAP12544 262 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMA2P25787 234 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 OXTRP30559 389 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LIMK1P53667 647 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ARF5P84085 180 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 POM121L1PQ3SYA9 428 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ACCSLQ4AC99 568 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SLFN11Q7Z7L1 901 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 RGL4Q8IZJ4 473 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2I1PQ8NGU4 316 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX19Q92543 992 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D31Q96DN5 1066 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 VCPIP1Q96JH7 1222 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 RTKNQ9BST9 563 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN10Q9HC96 672 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PARVAQ9NVD7 372 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO1AQ9UBC5 1043 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAI1Q9UI46 699 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SARDHQ9UL12 918 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 FZD10Q9ULW2 581 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRK1Q38SD2 2015 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ILVBLA1L0T0 632 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD62A6NC57 917 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CBX4O00257 560 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 RTN2O75298 545 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMPSTE24O75844 475 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSLP07711 333 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ENGP17813 658 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DRD3P35462 400 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK8P45983 427 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 GNA12Q03113 381 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB16Q05516 673 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA3BQ13214 749 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DLG2Q15700 870 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CA9Q16790 459 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 EFHC2Q5JST6 749 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 C22orf39Q6P5X5 142 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC23A3Q6PIS1 610 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ISCUQ9H1K1 167 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP13A1Q9HD20 1204 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM51Q9NW97 253 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM248Q9NWD8 314 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL12Q9NXK8 326 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087X0T9 212 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM191CA6NGB0 347 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf47A7E2U8 309 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL12A8MUP2 240 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1BP01584 269 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPING1P05155 500 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM228BP0C875 321 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TCF4P15884 667 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOQP17081 205 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC8A1P32418 973 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXD12P35452 270 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 NNMTP40261 264 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 LAYNQ6UX15 382 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP11CQ8NB49 1132 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 CADM4Q8NFZ8 388 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 GANCQ8TET4 914 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXJ1Q92949 421 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SPON2Q9BUD6 331 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD1Q9H0C5 482 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TNKS2Q9H2K2 1166 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 NENFQ9UMX5 172 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 CREB3O43889 395 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 CD160O95971 181 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV4-34P06331 123 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPKAPK2P49137 400 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 ADPRHP54922 357 aa19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms