RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 EBF1Q9UH73 591 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGAP6O43182 974 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 COMTP21964 271 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 SLC1A1P43005 524 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 KCTD6Q8NC69 237 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 HMCESQ96FZ2 354 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 SUN2Q9UH99 717 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0U1RQJ8 604 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 RASA4BC9J798 803 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 RASA4O43374 803 aa20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-255ENST00000498007 VAV1P15498 845 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 AMPD1P23109 780 aa20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-255ENST00000498007 ARF5P84085 180 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 MMRN1Q13201 1228 aa20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-255ENST00000498007 NETO2Q8NC67 525 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 OR2T3Q8NH03 318 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 TSC1Q92574 1164 aa20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-255ENST00000498007 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-255ENST00000498007 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.22■□□□□ 0.83
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HLA-B-255ENST00000498007 FRS2Q8WU20 508 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 GAB3Q8WWW8 586 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 RLN3Q8WXF3 142 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-255ENST00000498007 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.22■□□□□ 0.83
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