RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 PCP4P48539 62 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 PPATQ06203 517 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.582e-9■■■■□ 21.2
RBM39-241ENST00000496183 GPR162Q16538 588 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ALG10Q5BKT4 473 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 HMGB4Q8WW32 186 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 MARK4Q96L34 752 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ZNF347Q96SE7 839 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 RAB21Q9UL25 225 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 SHPRHQ149N8 1683 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 DNPH1O43598 174 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CYP3A7P24462 503 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 KLRK1P26718 216 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CCKARP32238 428 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 OAZ1P54368 228 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 LINC00205P59089 165 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 KLBQ86Z14 1044 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 SVIPQ8NHG7 77 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.2□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 KIF28PB7ZC32 967 aa5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 SETSIPP0DME0 302 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 RNF146Q9NTX7 359 aa5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CDC23Q9UJX2 597 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 BAG5Q9UL15 447 aa5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 PTCH1Q13635 1447 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 MCIDASD6RGH6 385 aa5.18□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 KAT7O95251 611 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 THBS3P49746 956 aa5.18□□□□□ -1.58
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RBM39-241ENST00000496183 NFRKBQ6P4R8 1299 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 EME1Q96AY2 570 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 EID2BQ96D98 161 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RBM39-241ENST00000496183 CNTN6Q9UQ52 1028 aa5.18□□□□□ -1.58
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