RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 MOCOSQ96EN8 888 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RILPQ96NA2 401 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ACBD6Q9BR61 282 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ACSS2Q9NR19 701 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 PNPOQ9NVS9 261 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 THAP1Q9NVV9 213 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NMRK1Q9NWW6 199 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 GLRA3O75311 464 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 PROCP04070 461 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NMBRP28336 390 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 IRF9Q00978 393 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CAP1Q01518 475 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KDSRQ06136 332 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KCNA10Q16322 511 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 TEKT5Q96M29 485 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 PKMYT1Q99640 499 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CAPN14A8MX76 684 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KPNA6O60684 536 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KRT36O76013 467 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SP100P23497 879 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SLC1A6P48664 564 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 FLT3LGP49771 235 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 USP4Q13107 963 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KRT72Q14CN4 511 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RGMBQ6NW40 437 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ISLR2Q6UXK2 745 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 METTL23Q86XA0 190 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ACMSDQ8TDX5 336 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 OCEL1Q9H607 264 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DCDC2Q9UHG0 476 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 A0A0U1RQF3 1178 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 B2RBV5 119 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ZCCHC18P0CG32 403 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 MX2P20592 715 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RPS6KA3P51812 740 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NRG4Q8WWG1 115 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DPF3Q92784 378 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ATP2A3Q93084 1043 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RBBP8Q99708 897 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CPNE1Q99829 537 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 17.1
PRAME-213ENST00000492657 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NCAM2O15394 837 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ZNF623O75123 536 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CAPN15O75808 1086 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 FESP07332 822 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SAT1P21673 171 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP8P85298 464 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ITGA9Q13797 1035 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DSC3Q14574 896 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RCN1Q15293 331 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 GRTP1Q5TC63 336 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 MAVSQ7Z434 540 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 18
PRAME-213ENST00000492657 WDR60Q8WVS4 1066 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CASP10Q92851 521 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 WWP1Q9H0M0 922 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NEU3Q9UQ49 428 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ETS2P15036 469 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ATP6V1C1P21283 382 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ACSBG2Q5FVE4 666 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SCD5Q86SK9 330 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 TEX9Q8N6V9 391 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SORT1Q99523 831 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 TUBB6Q9BUF5 446 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 NMUR1Q9HB89 426 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 SPC25Q9HBM1 224 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 RRN3Q9NYV6 651 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.4 ms