RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481605.5

TTC3-217, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 1,540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-217ENST00000481605 H0Y8X5 98 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 PLK4O00444 970 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 VILLO15195 856 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 EPHB6O15197 1021 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 CDR2Q01850 454 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 BNIPLQ7Z465 357 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 PSMB7Q99436 277 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 TMEM131Q92545 1883 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 E9PAM4 449 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 MCF2LO15068 1137 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 BNIP3LO60238 219 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 SNAP91O60641 907 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 MT-CO1P00395 513 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 SOX5P35711 763 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 CCT8P50990 548 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 JAM2P57087 298 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 ARCQ7LC44 396 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 SLCO6A1Q86UG4 719 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 FAM131BQ86XD5 332 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 FAM131CQ96AQ9 280 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 SKA1Q96BD8 255 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 HAPLN3Q96S86 360 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC3-217ENST00000481605 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 A0A0D9SEW6 157 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 TMEM8BA6NDV4 472 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 ALOX15BO15296 676 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SRGAP2O75044 1071 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 RTN2O75298 545 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 WNT1P04628 370 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SRCP12931 536 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 CHRNB2P17787 502 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PPP2CBP62714 309 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PPP2CAP67775 309 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 IL9RQ01113 521 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 FMO1Q01740 532 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 EMC1Q8N766 993 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SERAC1Q96JX3 654 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 CDC6Q99741 560 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 VPS51Q9UID3 782 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 AKAP13Q12802 2813 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 FAM221BA6H8Z2 402 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 WNT9AO14904 365 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 MMP8P22894 467 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 CD38P28907 300 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 OR1E1P30953 314 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 ATP11AP98196 1134 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 ARTNQ5T4W7 220 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 ANO10Q9NW15 660 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 KNL1Q8NG31 2342 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 K7ERQ8 282 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SLC7A4O43246 635 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 LATO43561 262 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PCDHGA12O60330 932 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 DFNA5O60443 496 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 GRK6P43250 576 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 CNTN1Q12860 1018 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 RRM1P23921 792 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 STAT1P42224 750 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 MYL5Q02045 173 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 SYCP1Q15431 976 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 AGBL4Q5VU57 503 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 LINGO4Q6UY18 593 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC3-217ENST00000481605 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms