RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 KRT31Q15323 416 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ALFQ53S48 1182 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 USP30Q70CQ3 517 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 XYLT1Q86Y38 959 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NEK11Q8NG66 645 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FAM129BQ96TA1 746 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NPY6RQ99463 290 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 STK33Q9BYT3 514 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRBP23467 1997 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PPC4 97 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FAM149AA5PLN7 773 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 E9PAM4 449 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SLC31A1O15431 190 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FLRT2O43155 660 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GJB3O75712 270 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PCDH8O95206 1070 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM16O95361 564 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 MT-CO1P00395 513 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ITGAVP06756 1048 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PRLRP16471 622 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GLDCP23378 1020 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SOX5P35711 763 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FLT3P36888 993 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 STAT1P42224 750 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CXCR3P49682 368 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ADPRHP54922 357 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2CBP62714 309 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2CAP67775 309 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 STAT4Q14765 748 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 EID2Q8N6I1 236 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 KDM1BQ8NB78 822 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 OR7D4Q8NG98 312 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GPT2Q8TD30 523 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC114Q96M63 670 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 EBF2Q9HAK2 575 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GDF3Q9NR23 364 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 ANO10Q9NW15 660 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 RRN3Q9NYV6 651 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 VPS51Q9UID3 782 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 SARDHQ9UL12 918 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 FZD4Q9ULV1 537 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.28□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0D9SEW6 157 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 WNT9AO14904 365 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 EPHB6O15197 1021 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 SDC3O75056 442 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 SRCP12931 536 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 SDC4P31431 198 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 CHRNA3P32297 505 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 NOMO3P69849 1222 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 CDR2Q01850 454 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 MTA1Q13330 715 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 STX1AQ16623 288 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 INAVAQ3KP66 663 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 RAB6CQ53S08 254 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 ARSIQ5FYB1 569 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-209ENST00000480420 PAF1Q8N7H5 531 aa8.27□□□□□ -1.09
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