RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 SNX11Q9Y5W9 270 aa13.37□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 ACTL7AQ9Y615 435 aa13.37□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 E9PAM4 449 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 CBFA2T2O43439 604 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 CLDN11O75508 207 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 F9P00740 461 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 CCDC172P0C7W6 258 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 UNGP13051 313 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 DRD3P35462 400 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 SCNN1AP37088 669 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 STAT1P42224 750 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 CDH4P55283 916 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 SHC2P98077 582 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 KIAA0895LQ68EN5 471 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 LINGO4Q6UY18 593 aa13.36□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 USP30Q70CQ3 517 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 ZNF677Q86XU0 584 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 OR7D4Q8NG98 312 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 SPAG5Q96R06 1193 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 MUC3BQ9H195 1237 aa13.36□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 SLC32A1Q9H598 525 aa13.36□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 MYO6Q9UM54 1294 aa13.36□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 C10orf142B7Z368 130 aa13.35□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 FAM72CH0Y354 149 aa13.35□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 SRCP12931 536 aa13.35□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.35□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.35□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 CTSLP07711 333 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 C1QTNF9P0C862 333 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 C5AR1P21730 350 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 OR1E1P30953 314 aa13.34□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 CCDC185Q8N715 623 aa13.34□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa13.34□□□□□ -0.27
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HPS1-211ENST00000478087 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 ADAM22Q9P0K1 906 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 PPM1HQ9ULR3 514 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 SCML1Q9UN30 329 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 BTBD3Q9Y2F9 522 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 ZZEF1O43149 2961 aa13.34□□□□□ -0.27
HPS1-211ENST00000478087 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa13.33□□□□□ -0.28
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