RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNJ15Q99712 375 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR174Q9BXC1 333 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM206Q9H813 350 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZMAT4Q9H898 229 aa4.31□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 GRIN1Q05586 938 aa4.3□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 ST3GAL1Q11201 340 aa4.3□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 EMC2Q15006 297 aa4.3□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TXNDC8Q6A555 127 aa4.3□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 LZTR1Q8N653 840 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 EID2Q8N6I1 236 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 HPS3Q969F9 1004 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MIB2Q96AX9 1013 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC39A13Q96H72 371 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 C16orf92Q96LL3 132 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.3□□□□□ -1.72
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ECHDC1-211ENST00000460558 CD93Q9NPY3 652 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ACSS2Q9NR19 701 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 C14orf119Q9NWQ9 140 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 DSEQ9UL01 958 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GDAQ9Y2T3 454 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ACANP16112 2415 aa4.3□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MYH11P35749 1972 aa4.29□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 STK36Q9NRP7 1315 aa4.29□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.29□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SMCO2A6NFE2 343 aa4.29□□□□□ -1.72
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