RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 TUBP50607 506 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 LIMK2P53671 638 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SEMA3BQ13214 749 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 GRM3Q14832 879 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PYDC1Q8WXC3 89 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 ZNF333Q96JL9 665 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 TM7SF2O76062 418 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 OR4Q2P0C623 313 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CTBP1Q13363 440 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 ITGA7Q13683 1181 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CYS1Q717R9 158 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CNTD1Q8N815 330 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 VPS39Q96JC1 886 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 COG4Q9H9E3 785 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CASS4Q9NQ75 786 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 HHLA1C9JL84 531 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PMPCBO75439 489 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 ITGB1P05556 798 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CD52P31358 61 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CUL3Q13618 768 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MAPK15Q8TD08 544 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SGF29Q96ES7 293 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 NEBLO76041 1014 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CHRNA1P02708 482 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 GNAT1P11488 350 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MPSTP25325 297 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MPP1Q00013 466 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PCSK7Q16549 785 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 RABGAP1LQ5R372 815 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 TMEM135Q86UB9 458 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
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HPS3-202ENST00000460120 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PPM1HQ9ULR3 514 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SERPINB5P36952 375 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SEPT6Q14141 434 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 NTAN1Q96AB6 310 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.48■□□□□ 0.55
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HPS3-202ENST00000460120 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SOX13Q9UN79 622 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 VAPBO95292 243 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PEX19P40855 299 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 COPAP53621 1224 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 HUNKP57058 714 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 BLMHQ13867 455 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 KCTD11Q693B1 232 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 OMDQ99983 421 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 FICDQ9BVA6 458 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SLC24A3Q9HC58 644 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MPP6Q9NZW5 540 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 G3V2L1 256 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MAGEC1O60732 1142 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 THPOP40225 353 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 GALNT2Q10471 571 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 PPFIBP2Q8ND30 876 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 HDAC11Q96DB2 347 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 TEKT5Q96M29 485 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 OR52B2Q96RD2 323 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 BATF3Q9NR55 127 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 CDH9Q9ULB4 789 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 A0A088AWK7 358 aa18.46■□□□□ 0.55
HPS3-202ENST00000460120 MAP3K7O43318 606 aa18.46■□□□□ 0.55
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