RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TTC30AQ86WT1 665 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 AKT1S1Q96B36 256 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RCN3Q96D15 328 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ALG9Q9H6U8 611 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TCHHQ07283 1943 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DCCP43146 1447 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 BTN3A1O00481 513 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RAD51BO15315 384 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC166P0CW27 439 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 OR1E1P30953 314 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 JAM2P57087 298 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FOLH1Q04609 750 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CAPSQ13938 189 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DDR2Q16832 855 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RAET1EQ8TD07 263 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SPOCK2Q92563 424 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM210AQ96ND0 272 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 APOL4Q9BPW4 351 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SEC22BO75396 215 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 LYPLA2O95372 231 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MED26O95402 600 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ITGB6P18564 788 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF410Q86VK4 478 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SERPINB11Q96P15 392 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 HGH1Q9BTY7 390 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 KRT84Q9NSB2 600 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PNPOQ9NVS9 261 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 NFKB1P19838 968 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SQLEQ14534 574 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 NCF4Q15080 339 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CEP78Q5JTW2 689 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PACS1Q6VY07 963 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 LUZP2Q86TE4 346 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 LGMNQ99538 433 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CDT1Q9H211 546 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CLUHO75153 1309 aa11.35□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RECQL4O94761 1208 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SNHG28P0DPA3 235 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PIK3R1P27986 724 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 GPC1P35052 558 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 UGCGQ16739 394 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DGUOKQ16854 277 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PFKFB4Q16877 469 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM228AQ86W67 206 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 OMDQ99983 421 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CEP44Q9C0F1 390 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 STMN3Q9NZ72 180 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PLLPQ9Y342 182 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MGRN1O60291 552 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ETS2P15036 469 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 USP4Q13107 963 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ACVR2BQ13705 512 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ARMC4Q5T2S8 1044 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.34□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 HMG20AQ9NP66 347 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms