RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 LRPAP1P30533 357 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 GNAQP50148 359 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 NAPAP54920 295 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ANO1Q5XXA6 986 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SLC2A7Q6PXP3 512 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ASTN1O14525 1302 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 PFASO15067 1338 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 NID2Q14112 1375 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 HOXC6P09630 235 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CYP2C9P11712 490 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 PDE6CP51160 858 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 NEK2P51955 445 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 WNT3P56703 355 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MYO1EQ12965 1108 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 UBE2SQ16763 222 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ODR4Q5SWX8 454 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ARMCX2Q7L311 632 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 NECAB1Q8N987 351 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TRPV1Q8NER1 839 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ZBTB9Q96C00 473 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 DEFB118Q96PH6 123 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CGRRF1Q99675 332 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 COL20A1Q9P218 1284 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 LTBP2Q14767 1821 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TET1Q8NFU7 2136 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SIP14410 1827 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 PPEF2O14830 753 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 PFKFB2O60825 505 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 THP07101 528 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CYBAP13498 195 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SCG2P13521 617 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 IFNAR1P17181 557 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SLC11A2P49281 568 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 RCAN1P53805 252 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 UCP3P55916 312 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 RAB1AP62820 205 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SATB1Q01826 763 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 TRAF1Q13077 416 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 RABEP1Q15276 862 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-209ENST00000415046 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 FCRL6Q6DN72 434 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 IL31RAQ8NI17 732 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 CUL5Q93034 780 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 C5orf34Q96MH7 638 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 AIFM3Q96NN9 605 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 SNX18Q96RF0 628 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-209ENST00000415046 RMDN3Q96TC7 470 aa4.91□□□□□ -1.62
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