RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 VILLO15195 856 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SRCP12931 536 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 KRT31Q15323 416 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 LINGO4Q6UY18 593 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 EMC1Q8N766 993 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SERAC1Q96JX3 654 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 STK33Q9BYT3 514 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 VPS51Q9UID3 782 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 E9PAM4 449 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 K7ERQ8 282 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 EPHB6O15197 1021 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SRGAP2O75044 1071 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 GLDCP23378 1020 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 CD38P28907 300 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SCNN1AP37088 669 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 KRT83P78385 493 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ATP11AP98196 1134 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 CDO1Q16878 200 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 RAB6CQ53S08 254 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 LRRC31Q6UY01 552 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 FAM131BQ86XD5 332 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 OR7D4Q8NG98 312 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 GPT2Q8TD30 523 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 NT5C3BQ969T7 300 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 CDC6Q99741 560 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 MYLKQ15746 1914 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 AKAP13Q12802 2813 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 A0A1B0GTQ1 180 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 A0A1W2PR77 199 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 C10orf142B7Z368 130 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 AGBL4Q5VU57 503 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 FAM46CQ5VWP2 391 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 SKA1Q96BD8 255 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 FAM221BA6H8Z2 402 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 DRGXA6NNA5 263 aa15.92■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 CBX4O00257 560 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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ACTB-202ENST00000414620 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 PCDHGA12O60330 932 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 ENDOD1O94919 500 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 TPM2P07951 284 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 CHRNB2P17787 502 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 OR1E1P30953 314 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SOX5P35711 763 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SCAPQ12770 1279 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SHBQ15464 509 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 CHST14Q8NCH0 376 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-202ENST00000414620 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.92■□□□□ 0.14
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