RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 H0Y626 953 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 JCHAINP01591 159 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SGSHP51688 502 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZBTB17Q13105 803 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CDH18Q13634 790 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PRPSAP1Q14558 356 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CENPUQ71F23 418 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MCUQ8NE86 351 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 DDI1Q8WTU0 396 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 MAP2K7O14733 419 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PRAMEF12O95522 483 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 METTL18O95568 372 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 APRTP07741 180 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 LMAN1P49257 510 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAM15Q13444 863 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 HIF1AQ16665 826 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CES5AQ6NT32 575 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC25Q86WR0 208 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PDIK1LQ8N165 341 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 NOTCH4Q99466 2003 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PRAMEF11O60813 436 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PMS2P54278 862 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TNK2Q07912 1038 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 NPAS3Q8IXF0 933 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 BBS5Q8N3I7 341 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CARNMT1Q8N4J0 409 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 AGAP3Q96P47 875 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TRANK1O15050 2925 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PSMD3O43242 534 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 IFNAR2P48551 515 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CFAP58Q5T655 872 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 MARC1Q5VT66 337 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD22Q5VYY1 191 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ALS2CLQ60I27 953 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF43Q68DV7 783 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 IL31Q6EBC2 164 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 MFN1Q8IWA4 741 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CEP41Q9BYV8 373 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 MUC3BQ9H195 1237 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 OBP2AQ9NY56 170 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 KDELR3O43731 214 aa25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM63AO94886 807 aa25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PSMB4P28070 264 aa25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CBLBQ13191 982 aa25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 SMARCD2Q92925 531 aa25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP13A1Q9HD20 1204 aa25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 LINC01565O15544 149 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ACVRL1P37023 503 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 FAXCQ5TGI0 409 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TEX26Q8N6G2 289 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 FGF13Q92913 245 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TTC25Q96NG3 672 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 CACNG3O60359 315 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PEX11BO96011 259 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 HSD17B3P37058 310 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 MMP13P45452 471 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 E2F7Q96AV8 911 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ASB16Q96NS5 453 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 FCRL5Q96RD9 977 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 SPON2Q9BUD6 331 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 TRPV4Q9HBA0 871 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 PDFQ9HBH1 243 aa25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A0D9SEW6 157 aa25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 J3KR12 359 aa25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 ANXA9O76027 345 aa25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 MLNP12872 115 aa25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3-201ENST00000379215 NFKB1P19838 968 aa25.03■■□□□ 1.6
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