RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK8P45983 427 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NAGLUP54802 743 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 EID3Q8N140 333 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MREGQ8N565 214 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RNF19AQ9NV58 838 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CBX6O95503 412 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CDK20Q8IZL9 346 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FAM50BQ9Y247 325 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CRY1Q16526 586 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf46Q6P387 395 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DPF3Q92784 378 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ARL15Q9NXU5 204 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM17Q9Y577 477 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 OPLAHO14841 1288 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CALCAP01258 141 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FGRP09769 529 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 S100A3P33764 101 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 HYIQ5T013 277 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RNF148Q8N7C7 305 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TGFB1I1O43294 461 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF862O60290 1169 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM237Q96Q45 408 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 19.6
CCSAP-203ENST00000366687 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TPP1O14773 563 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF9P41273 254 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NPNTQ6UXI9 565 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CLOCKO15516 846 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MTERF3Q96E29 417 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FSCN2O14926 492 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TM4SF1P30408 202 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PROCP04070 461 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CCNB1P14635 433 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RXRGP48443 463 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2K5Q13163 448 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LBPP18428 481 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RNF145Q96MT1 663 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CLTBP09497 229 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NFKB1P19838 968 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CLCN5P51795 746 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2A13Q16696 494 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ATG7O95352 703 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NEK3P51956 506 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms