RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM10O14672 748 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TP73O15350 636 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3BP5O60239 455 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEURL1O76050 574 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBX6O95503 412 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT1P04628 370 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCKP06239 509 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCGR2AP12318 317 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBLP22087 321 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLRC2P26717 231 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNF1BP35680 557 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTNR1AP48039 350 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 C21orf58P58505 322 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT2Q10471 571 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR68Q15743 365 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFIL3Q16649 462 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q4G0T1 1027 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIDNQ504T8 468 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTX3Q5HYI7 312 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH2D4BQ5SQS7 431 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC39AQ5SRH9 613 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORN5Q5VZ52 161 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF626Q68DY1 528 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A25Q6T423 547 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEF8Q6ZN54 512 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFN1Q86VF2 1251 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 GHDCQ8N2G8 530 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCP11L2Q8N4U5 519 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM217Q8N7C4 229 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX19Q8NA77 164 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HVCN1Q96D96 273 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 EYA3Q99504 573 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAOK3Q9H2K8 898 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM184CQ9NVA4 438 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANAPC4Q9UJX5 808 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMP3Q9UQV4 416 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSGIN2Q9Y236 505 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6C68A6NDL8 312 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A7PA6NKC0 464 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A22PA8MWA6 464 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A12PA8MX19 464 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXO6A8MYZ6 492 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3KRW8 73 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 PER2O15055 1255 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLR2O60603 784 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TULP3O75386 442 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDAH2O95865 285 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRM4P08173 479 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD53P19397 219 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD72P21854 359 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT9P35527 623 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGT5P36269 586 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP13P45452 471 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TDGQ13569 410 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLK5Q496M5 336 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf10Q5SRN2 563 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM268Q5VZI3 342 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL5Q6EMB2 1281 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHC4Q6S5L8 630 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MON1AQ86VX9 555 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPP10Q8N608 796 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF366Q8N895 744 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC44A5Q8NCS7 719 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGOQ8TEQ8 1089 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAR1Q8WVX9 515 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB40AQ8WXH6 277 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST8SIA4Q92187 359 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 EME1Q96AY2 570 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELP4Q96EB1 424 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF125Q96EQ8 232 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC26A6Q9BXS9 759 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMAN2LQ9H0V9 348 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC45AQ9H3U1 944 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIPK3Q9H422 1215 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms