RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332149.9

TMPRSS2-201, Transcript of transmembrane serine protease 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMPRSS2, Length 3,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS2-201ENST00000332149 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 HERVK_113Q902F9 699 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 HMX2A2RU54 273 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 RFPL1O75677 317 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TACR2P21452 398 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 HOXA9P31269 272 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MGAT5Q09328 741 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 DUSP4Q13115 394 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 FBXL22Q6P050 247 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 STKLD1Q8NE28 680 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SMC6Q96SB8 1091 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 IL21Q9HBE4 155 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 FGF19O95750 216 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SLC7A9P82251 487 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 HECTD3Q5T447 861 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 GRTP1Q5TC63 336 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MPP5Q8N3R9 675 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CPXM2Q8N436 756 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CPNE1Q99829 537 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TLDC2A0PJX2 215 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MMP2P08253 660 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 NFKB1P19838 968 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 RENBPP51606 427 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TMED2Q15363 201 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ITIH5Q86UX2 942 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TREX1Q9NSU2 369 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TLR5O60602 858 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 KRT37O76014 449 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 POLBP06746 335 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 GSTA1P08263 222 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SLCO1A2P46721 670 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 DEFB103AP81534 67 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PID1Q7Z2X4 250 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TMC8Q8IU68 726 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ILVBLA1L0T0 632 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 BIRC5O15392 142 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 AVILO75366 819 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 KRT38O76015 456 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CRHR1P34998 444 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 IL9RQ01113 521 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 LAMB3Q13751 1172 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SPARCL1Q14515 664 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MPP7Q5T2T1 576 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TAC1P20366 129 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 OR1D2P34982 312 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 PCID2Q5JVF3 399 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 IGSF8Q969P0 613 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CABS1Q96KC9 395 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 MGME1Q9BQP7 344 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 SYBUQ9NX95 663 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CLDN11O75508 207 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 GJB5O95377 273 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 TGDSO95455 350 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 URODP06132 367 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 CREB1P16220 341 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS2-201ENST00000332149 KRT15P19012 456 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms