RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.77■■□□□ 1.72
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SENP3-201ENST00000321337 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 SPATA6LQ8N4H0 392 aa25.76■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.76■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.75■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 C22orf31O95567 290 aa25.75■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 DESP17661 470 aa25.75■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.75■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 RAP2CQ9Y3L5 183 aa25.75■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 GAB3Q8WWW8 586 aa25.74■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 LRRC40Q9H9A6 602 aa25.74■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 GJD2Q9UKL4 321 aa25.74■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 SULT1E1P49888 294 aa25.73■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.73■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 LBX2Q6XYB7 198 aa25.73■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 TMEM135Q86UB9 458 aa25.73■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 STRNO43815 780 aa25.73■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 RPL10P27635 214 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
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SENP3-201ENST00000321337 FAM72DQ6L9T8 149 aa25.73■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 DLK2Q6UY11 383 aa25.73■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 GK5Q6ZS86 529 aa25.73■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 FAM72BQ86X60 149 aa25.73■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 SNX31Q8N9S9 440 aa25.73■■□□□ 1.71
SENP3-201ENST00000321337 KCTD4Q8WVF5 259 aa25.73■■□□□ 1.71
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