RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SYT13Q7L8C5 426 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 HMCESQ96FZ2 354 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 HOXB2P14652 356 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NNMTP40261 264 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CXCL12P48061 93 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 DNA2P51530 1060 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CCR3P51677 355 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SATB1Q01826 763 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 LZTR1Q8N653 840 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF366Q8N895 744 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 FAF2Q96CS3 445 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RNF157Q96PX1 679 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 KLC2Q9H0B6 622 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC19Q9H756 370 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RAD54BQ9Y620 910 aa22.85■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 DFFAO00273 331 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 LAMTOR5O43504 91 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 HLA-EP13747 358 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PRKCHP24723 683 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINB6P35237 376 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RWDD2BP57060 319 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 LLGL1Q15334 1064 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RETSATQ6NUM9 610 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 LINGO4Q6UY18 593 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 VSIG1Q86XK7 387 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RFX6Q8HWS3 928 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 EXD1Q8NHP7 514 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 MYO19Q96H55 970 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF487B1APH4 448 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 EPHX1P07099 455 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SERINC3Q13530 473 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CRY1Q16526 586 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PQLC3Q8N755 202 aa22.84■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 TMEM245Q9H330 911 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 KDELR3O43731 214 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ZMPSTE24O75844 475 aa22.83■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 CDKN2BP42772 138 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PEX5P50542 639 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ARF5P84085 180 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ENPP2Q13822 863 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ACCSLQ4AC99 568 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 AFMIDQ63HM1 303 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 KAZNQ674X7 775 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ALG3Q92685 438 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 HES6Q96HZ4 224 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 USP27XA6NNY8 438 aa22.82■■□□□ 1.24
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HOXD4-201ENST00000306324 MFSD11O43934 449 aa22.82■■□□□ 1.24
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HOXD4-201ENST00000306324 DYNLT1P63172 113 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 STARD3Q14849 445 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 KDM1BQ8NB78 822 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 HHIPQ96QV1 700 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.82■■□□□ 1.24
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HOXD4-201ENST00000306324 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 COL9A1P20849 921 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 TSSK4Q6SA08 328 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 MTG2Q9H4K7 406 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQF6 199 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXD4-201ENST00000306324 K7ERQ8 282 aa22.8■■□□□ 1.24
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