RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 COMMD9Q9P000 198 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0J9YVX5 310 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ADORA2BP29275 332 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GRIK1P39086 918 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GRIA3P42263 894 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZBED5Q49AG3 693 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 BOLA3Q53S33 107 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MFSD5Q6N075 450 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 POTEHQ6S545 545 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SZRD1Q7Z422 152 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 EDARQ9UNE0 448 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NWD1Q149M9 1564 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SH3D21A4FU49 640 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 E7ENX8 843 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GUCA1CO95843 209 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2A2P52657 109 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MYLPFQ96A32 169 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NAT9Q9BTE0 207 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0U1RQJ8 604 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 H3BMM5 538 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MYL12BO14950 172 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB7AO95365 584 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAXCQ5TGI0 409 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 XKRXQ6PP77 449 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MPP5Q8N3R9 675 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ITFG1Q8TB96 612 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MED28Q9H204 178 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ELP3Q9H9T3 547 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 B3GALNT1O75752 331 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 MAGEA2P43356 314 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PSME3P61289 254 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PON2Q15165 354 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF276Q8N554 614 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PDGFRAP16234 1089 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TGFBR2P37173 567 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SULT1E1P49888 294 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMC2Q8TDI7 906 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 HIPK3Q9H422 1215 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TPPPO94811 219 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TROAPQ12815 778 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMC7Q7Z402 723 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 AGAP3Q96P47 875 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 OR7A10O76100 309 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ETS1P14921 441 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00523Q86TU6 105 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 RTKNQ9BST9 563 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 XKR8Q9H6D3 395 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 CYP4X1Q8N118 509 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LEMD2Q8NC56 503 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 A6NHS1 94 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 SREBF1P36956 1147 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRO-201ENST00000281171 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms