RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 RINLQ6ZS11 566 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF180Q86T96 592 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 KCNMB4Q86W47 210 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM13CQ8NE31 585 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 FICDQ9BVA6 458 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 AURKAO14965 403 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MX2P20592 715 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 OCRLQ01968 901 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 USP4Q13107 963 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 GIPC2Q8TF65 315 aa16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PLIN3O60664 434 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MAFKO60675 156 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 HLA-DQB2P05538 268 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CD1EP15812 388 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 RAB27AP51159 221 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MPP1Q00013 466 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SEPT6Q14141 434 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MTBPQ96DY7 904 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SERPINB6P35237 376 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PEX6Q13608 980 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PCLAFQ15004 111 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CNGA3Q16281 694 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM135Q86UB9 458 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 RAET1EQ8TD07 263 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CLPTM1LQ96KA5 538 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CASS4Q9NQ75 786 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 E9PAM4 449 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 GP5P40197 560 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 RAPH1Q70E73 1250 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A096LPK6 155 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 TOMM70O94826 608 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 UPP2O95045 317 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 GABRB3P28472 473 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SERPINB9P50453 376 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 IHHQ14623 411 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 GRM3Q14832 879 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MGAT5BQ3V5L5 792 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SKA1Q96BD8 255 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SLC20A1-201ENST00000272542 NEBLO76041 1014 aa16.08■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TCTN1Q2MV58 587 aa16.08■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SGF29Q96ES7 293 aa16.08■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TK2O00142 265 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 C2P06681 752 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC1A6P48664 564 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 HCAR3P49019 387 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ARTNQ5T4W7 220 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MBLAC2Q68D91 279 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 IL31Q6EBC2 164 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 DPF3Q92784 378 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 SCLYQ96I15 445 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 OMDQ99983 421 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CHD7Q9P2D1 2997 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 MEI4A8MW99 385 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 ANP32DO95626 131 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 IGLV3-25P01717 112 aa16.07■□□□□ 0.16
SLC20A1-201ENST00000272542 CPB1P15086 417 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms