RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM7Q9C029 511 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB7Q9H672 318 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KLC4Q9NSK0 619 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FETUBQ9UGM5 382 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM120BA0PK00 339 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRD1A4D1F6 860 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP69A5D8W1 941 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SGK1O00141 431 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF197O14709 1029 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MCF2LO15068 1137 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CHUKO15111 745 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ALOX15BO15296 676 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CHADO15335 359 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG6O75602 509 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 VDRP11473 427 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT3P12035 628 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BRAFP15056 766 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CD58P19256 250 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FGFR3P22607 806 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMARCE1-201ENST00000264640 AXLP30530 894 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH3A1P30838 453 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ELF1P32519 619 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BRCC3P46736 316 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SCTRP47872 440 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS41P49754 854 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSEP51690 589 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R40P59535 323 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MYL6P60660 151 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 IRX4P78413 519 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GPS1Q13098 491 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SPARCL1Q14515 664 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SETDB1Q15047 1291 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM187BQ17R55 369 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LONRF1Q17RB8 773 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KAZNQ674X7 775 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT6BQ92526 530 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HAUS1Q96CS2 278 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MSANTD3Q96H12 275 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SMC6Q96SB8 1091 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FZD8Q9H461 694 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM51Q9NW97 253 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RAXQ9Y2V3 346 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PRU2 124 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM170AA1A519 330 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RASA4BC9J798 803 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RASA4O43374 803 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX3O60493 162 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RECQL4O94761 1208 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GAT3O94766 335 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOBTB1O94844 696 aa7.24□□□□□ -1.25
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