RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172298.7

Rab11a-208, Transcript of Ras-related protein Rab-11A, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab11a, Length 2,336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Trap1	Q9CQN1	706 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Orc3	Q9JK30	715 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ctbp1	O88712	441 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Pdgfrb	P05622	1098 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Sbk3	P0C5K0	361 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Folr1	P35846	255 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gdf5	P43027	495 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Garnl3	Q3V0G7	1038 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ppp1r1b	Q60829	194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ptpn18	Q61152	453 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Znf148	Q61624	794 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Inpp4b	Q6P1Y8	924 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Tdpoz3	Q717B4	365 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Cplx4	Q80WM3	160 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Als2cr12	Q8BVM7	383 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Tbc1d17	Q8BYH7	645 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Dcun1d2	Q8BZJ7	259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Asb14	Q8C6Y6	587 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Scara3	Q8C850	606 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Aco2	Q99KI0	780 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Lgals2	Q9CQW5	130 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Atp6v1e2	Q9D593	226 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Tmem81	Q9D5K1	259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Igkv18-36	A0A075B5M9	114 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Fbxl18	E9PYR1	771 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Morc3	F7BJB9	942 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Syngr1	O55100	234 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Cd2	P08920	344 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Cd247	P24161	164 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Myl2	P51667	166 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Aff3	P51827	1254 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Rpl10a	P53026	217 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Dact3	Q0PHV7	610 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Olfr1505	Q7TQQ2	316 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gtf2a2	Q80ZM7	109 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Nod1	Q8BHB0	953 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Trerf1	Q8BXJ2	1205 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Acsl5	Q8JZR0	683 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Acad10	Q8K370	1069 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Tmem161a	Q8VCA6	480 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Pglyrp2	Q8VCS0	530 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Pcdha5	Q91Y15	934 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ddo	Q922Z0	341 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Mrpl9	Q99N94	265 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Commd8	Q9CZG3	183 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gmpr	Q9DCZ1	345 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Scube2	Q9JJS0	997 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Plod1	Q9R0E2	728 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Triobp	Q99KW3	2014 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Pramef17	A2ASJ1	475 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gm5415	E9PXF3	478 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Zbtb11	G5E8B9	1050 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Znf683	I7HJS4	458 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Adcy1	O88444	1118 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Wdr5	P61965	334 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Myadml2	Q08AU7	307 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Cd6	Q61003	665 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gpr19	Q61121	415 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Nab1	Q61122	486 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Nomo1	Q6GQT9	1214 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Rbm22	Q8BHS3	420 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Fsbp	Q8BKE5	299 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Znf689	Q8BKK5	500 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Zfp449	Q8CB76	518 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ipo11	Q8K2V6	975 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Sgpl1	Q8R0X7	568 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Rprd1a	Q8VDS4	312 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Olfr1353	Q8VGU8	309 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Pcdhb13	Q91Y06	796 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	March2	Q99M02	246 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Acot13	Q9CQR4	140 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Nt5c3a	Q9D020	331 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ebag9	Q9D0V7	213 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Fam227b	Q9D518	532 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gkap1	Q9JMB0	366 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Rp1l1	Q8CGM2	1859 aa		12.85	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Trbv4	A0A075B5I2	113 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Olfr1049	A2ARZ0	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ttll11	A4Q9F4	727 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Kifc5b	E9PUA5	672 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Gm6588	E9Q3K0	461 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Tnfaip1	O70479	316 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Slc2a7	P0C6A1	513 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ncan	P55066	1268 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Sap25	Q1EHW4	186 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Zyg11b	Q3UFS0	744 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Drc1	Q3USS3	753 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Nfe2l2	Q60795	597 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Krt32	Q62168	407 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Htr1a	Q64264	421 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Chsy1	Q6ZQ11	800 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Ostm1	Q8BGT0	338 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Agps	Q8C0I1	645 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Fam204a	Q8C6C7	236 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Trabd	Q99JY4	376 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Pgam1	Q9DBJ1	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Mkks	Q9JI70	570 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Prmt1	Q9JIF0	371 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Mpp6	Q9JLB0	553 aa		12.84	□□□□□ -0.35
Rab11a-208	ENSMUST00000172298	Cacna2d3	Q9Z1L5	1091 aa		12.84	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.1 ms