RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmbim4Q9DA39 238 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plxnb3Q9QY40 1902 aa18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhox3fA2ANE1 215 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grik3B1AS29 919 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CrymO54983 313 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scd1P13516 355 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CalrP14211 416 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il1rapl1P59823 695 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 StacP97306 403 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcar1Q61140 874 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp90Q61967 636 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Deup1Q7M6Y5 601 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ItchQ8C863 864 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9D979 236 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chmp2aQ9DB34 222 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tcp11x2A2AEI7 503 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcng1A2BDX4 514 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm15155B1B034 138 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp758E9QAA1 583 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EsrraO08580 422 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prl3b1P09586 222 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd163Q2VLH6 1121 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myo1gQ5SUA5 1024 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cntn4Q69Z26 1026 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Inppl1Q6P549 1257 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Naa25Q8BWZ3 972 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgap25Q8BYW1 648 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Robo4Q8C310 1012 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ano4Q8C5H1 955 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Acvr1cQ8K348 493 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekhh3Q8VCE9 796 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atpaf2Q91YY4 289 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Txndc12Q9CQU0 170 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Psmd8Q9CX56 353 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep83Q9D5R3 692 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RhojQ9ER71 214 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HemgnQ9ERZ0 503 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Shcbp1Q9Z179 668 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smok3cA0A087WSF2 504 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930558K02RikE0CXC6 182 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gml2G5E8L7 176 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r67K7N6T2 851 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Exoc7O35250 697 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AvilO88398 819 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt6aP50446 553 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdh9P70407 786 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lypla1P97823 230 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Echdc2Q3TLP5 296 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ADGRF3Q58Y75 991 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gata6Q61169 589 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chst10Q6PGK7 356 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb41Q811F1 908 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slco2b1Q8BXB6 683 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asb14Q8C6Y6 587 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slfn5Q8CBA2 884 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sgip1Q8VD37 806 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rabep2Q91WG2 554 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc13a3Q91Y63 600 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oser1Q9D722 291 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ten1Q9D7K2 161 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nupr1Q9WTK0 80 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ap4b1Q9WV76 738 aa18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prr14lE9Q7C4 1971 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alas2P08680 587 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nxpe4Q52KP5 543 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp4aQ64436 1033 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rasa4Q6PFQ7 802 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tas2r129Q7M709 320 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1415Q7TQS4 311 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf168Q80XJ2 565 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zcchc4Q8BKW4 512 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpa1Q8BLA8 1125 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem74Q8BQU7 305 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ago3Q8CJF9 860 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1494Q8VGP8 315 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1416Q8VGU4 312 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim7Q923T7 510 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nme5Q99MH5 211 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CenpsQ9D084 142 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rfc5Q9D0F6 339 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r27D3YUK6 857 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klf6O08584 283 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ift81O35594 676 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms